Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms