Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP8P40818 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP8P40818 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms