Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLH1P40692 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms