Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms