Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms