Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms