Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms