Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM66O15016 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms