Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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