Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms