Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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