Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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