Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms