Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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