Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms