Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms