Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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