Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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