Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms