Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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