Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DDI1-201ENST00000302259 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FP565260.1-201ENST00000617716 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms