Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms