Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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TNP2Q05952 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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