Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms