Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD12P35452 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD12P35452 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXD12P35452 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXD12P35452 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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