Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms