Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms