Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPREP23469 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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