Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCP1P17987 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms