Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms