Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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