Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms