Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QRK9 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QRK9 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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