Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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