Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms