Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AMBRA1Q9C0C7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms