Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms