Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms