Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms