Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms