Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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