Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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