Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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