Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms