Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms