Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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