Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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