Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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