Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms