Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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